对谷物和芸苔属植物具有致病性的树状黄单胞菌的 PCR 诊断靶基因的选择

对谷物和芸苔属植物具有致病性的树状黄单胞菌的 PCR 诊断靶基因的选择

应用领域:现代农业

我有意向
国家/地区

俄罗斯

行业领域

现代农业

简介

2001 至 2008 年间,在俄罗斯分离出多种可侵染小麦、黑麦、大麦、番茄、向日葵和芸苔属植物的植物病原性黄单胞菌。本研究通过生理学测试和多位点序列分型分析,确定了这些菌株在 Xanthomonas arboricola 种内的分类地位。对源自大麦的代表性菌株 3004 进行的基因组草图测序显示,该菌株缺失了 3 型分泌系统 (T3SS),并存在来自远缘细菌的水平基因转移证据,其中包括一些毒力基因。基于此,研究人员认为 4 型分泌系统 (T4SS) 相关基因可作为针对该新兴病原菌进行组特异性 PCR 分析的理想靶标。研究建议使用 virD4、virB3、virB4 和 virB9 基因设计检测系统。在对这些候选基因进行初步的经典 PCR 试验后,最终设计了针对 virD4 基因 121 bp 片段的特异性引物和 TaqMan® 探针。实验结果表明,该检测方法能够成功扩增所有目标 Xanthomonas arboricola 菌株的 DNA 片段,而其他在相同宿主植物上发现的黄单胞菌物种以及其他致病或附生细菌均未产生扩增产物。经验证,该检测方法可便捷地用于检测患病植物和半选择性培养基上分离的细菌菌落中的 Xanthomonas arboricola 感染,且其灵敏度和特异性均优于传统的平板计数法。

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